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自互补AAV(scAAV)——快速、高效、长时表达载体

作者:和元生物技术(上海)股份有限公司 2022-02-28T10:40 (访问量:4071)

重组腺相关病毒( Recombinant adeno-associated virus, rAAV)是一种无包膜、以单链DNA为遗传物质、基因组容量4.7kb的复制缺陷型微小病毒。rAAV具有多种血清型可亲嗜不同靶器官,免疫原性极低安全性高,2-3周可达到表达高峰且长时间稳定表达等特点,因此,rAAV广泛应用于动物研究、基础研究和基因治疗领域。

scAAV.jpg


自互补AAVSelf-complementary AAV, scAAV)在rAAV的基础上将其编码区域设计成双链DNA,因此scAAV感染细胞后互补部分互补形成双链DNA,然后进行转录、翻译,不需等待第二链DNA合成,取消了rAAV基因表达的限速步骤,缩短了开始表达的时间,scAAV感染后一般3-5天即可到达表达高峰。但也正是scAAV的双链DNA结构,致使其容量缩小至2.1kb,因此外源目的基因大小需要控制在1kb左右。

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1 ssAAVscAAV肝脏表达(1E+11 VG/只,尾静脉注射)


自互补AAV应用领域

1. 干扰靶点筛选

短发夹RNAShort hairpin RNA, shRNA)克隆进病毒载体感染细胞后,在细胞中表达小干扰RNASmall interfering RNA, siRNA),抑制mRNA转录,实现抑制目的基因表达目的。对于未知的干扰靶基因的筛选一般采取体外实验的方式进行验证,在细胞系上进行验证时常会遇到体外有效果体内无效果的情况;或在原代细胞上验证,原代细胞分离难度大、培养难度高也同样制约了shRNA的靶基因效果验证;常规体内筛选靶点的方式又大大的影响了研究的速度。然而,scAAV-shRNA筛选干扰靶点可以快速并且准确地获得干扰结果,极大的加快了研究的效率。

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2 scAAV2/8-WT1 shRNA抑制Wt1基因在肾脏表达

Chen T L, et al., The Scientific World Journal, 2014

2. 基因编辑

CRISPR/Cas9技术通过对基因水平操作实现基因敲除或基因定点编辑。利用病毒载体表达向导RNAguide RNA, gRNA),配合Cas9小鼠/病毒,可以对小鼠的目的基因进行编辑。

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3 肌肉注射AAV9基因编辑元件传递到D52 DMD小鼠改善营养不良蛋白表达

Min Y L, et al., Molecular Therapy, 2020

3. 基因敲降

Cre-LoxP重组酶体系因其特异性质,广泛应用在基因敲除(Knock outKO)或敲入(Knock inKI)研究中,目前常用转基因小鼠来实现。转基因小鼠由于构建周期长,价格高,繁育时间久,部分基因敲除或过表达胚胎致死等原因制约了研究的顺利进行,然而,病毒载体可以克服以上研究中出现的问题。scAAV-cre配合Flox小鼠使用,可在成年或幼年小鼠上实现快速基因敲降(Knock down, KD)。

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4 scAAV-CreRosa26报告小鼠肝脏中表达

Chen S, et al., Angiogenesis, 2010

4. 特异性标记

另外,利用Cre小鼠或scAAV-Cre配合scAAV-DIO实现更加精细、快速的细胞标记。

图5.png

5 scAAV-FLEx-mRuby2荧光蛋白在HVC(X)细胞群中限制性表达

Sánchez-Valpuesta M, et al.,PNAS, 2019

5. 过表达

利用scAAV过表达目的基因可以实现改目的基因在体内快速表达的目的,但是值得注意的是,由于scAAV容量有限,为了保证出毒及感染效率,目的基因尽量选择1kb以内。

图6.png

6 scAAV9-GFP感染皮层,三天结果

小结

scAAV具有多种血清型、快速表达、稳定表达、免疫原性相对较低的特点,因此适用于多种应用场景。

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